第壹，增值稅銷售收入與企業所得稅營業收入的區別分析；
壹般情況下，增值稅的銷售收入壹般不大於企業所得稅的營業收入，因為企業所得稅營業收入的外延大於增值稅的銷售收入，所以這個疑點要著重分析。在征管情況分析中，發現以下問題:
1.增值稅銷售收入正確，所得稅營業收入錯誤。隨著金稅工程的逐步深入和征管質量的不斷提高，增值稅銷售收入管理日趨完善，增值稅銷售收入相對真實可靠。有的納稅人人為低估所得稅收入，以達到少繳稅的目的；
2.增值稅銷售收入錯誤，所得稅營業收入正確。在中小企業中，為提高征管質量，降低零負申報率，在當期進項稅額固定的情況下，人為增加增值稅銷售收入，導致增值稅銷售收入大於所得稅營業收入；
3.增值稅銷售收入和所得稅收入不正確。這種錯誤是由於不正確的納稅申報或計算錯誤造成的。通過對征管系統中兩次收入申報執行情況的分析，系統只累計增值稅銷售收入月數和所得稅營業收入季數，得出年度累計數，並不默認為期末或年度申報表中填寫的累計數。有的企業在填報申報表時，漏填或錯填本期發生額，也導致收入不正確。
二是增值稅銷售收入與企業營業收入的差異分析；
由於企業所得稅的業務收入包含非增值稅銷售收入和視同銷售收入，在增值稅會計處理中，視同銷售收入只進行增值稅納稅調整而不進行收入處理，補貼收入等特殊收入在季度申報所得稅時計入業務收入，因此增值稅銷售收入小於企業業務收入是正常的。然而，通過實施分析，發現了以下問題:
1.所得稅收入是正確的，但增值稅銷售收入是錯誤的。納稅人為少繳增值稅少申報或不申報銷售額，這種情況比較少見，對於開票不規範、增值稅和企業所得稅分別由兩個稅務機關管理的企業，都有可能發生；
2.增值稅銷售收入和所得稅營業收入存在錯誤。這種錯誤是由於不正確的納稅申報或計算錯誤造成的。