壹、丟失出口貨物增值稅專用發票
根據國稅函[2010] 162號《關於外貿企業丟失增值稅專用發票抵扣聯出口退稅有關問題的通知》，對外貿企業丟失增值稅專用發票抵扣聯辦理出口退稅的處理辦法如下：
1、外貿企業丟失已開具增值稅專用發票發票聯和抵扣聯的，在增值稅專用發票認證相符後，可憑增值稅專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關審核同意後，向主管出口退稅的稅務機關申報出口退稅。
2、外貿企業丟失已開具增值稅專用發票抵扣聯的，在增值稅專用發票認證相符後，可憑增值稅專用發票發票聯復印件向主管出口退稅的稅務機關申報出口退稅。
丟失出口貨物稅收專用繳款書
出口企業丟失出口貨物稅收專用繳款書的，則須提供由供貨企業所在地縣級以上主管征稅機關出具的有關該批貨物稅收專用繳款書已開具證明、以及縣級以上征稅機關簽署意見並蓋章的原稅收專用繳款書復印件和供貨企業所在地銀行出具的該批出口貨物原稅收專用繳款書所列稅款已入庫證明，經審核無誤後方可辦理退稅。
二、出口貨物報關單（出口退稅聯）
出口企業丟失出口貨物報關單（出口退稅聯）的，在貨物出口後的六個月內可憑主管退稅機關出具的補辦出口貨物報關單（出口退稅聯）證明，向海關提出補辦申請。出口企業向主管退稅機關申請出具補辦出口貨物報關單（出口退稅聯）證明時，應提交下列資料：
關於申請出具補辦出口貨物報關單（出口退稅聯）證明的報告；
出口收匯核銷單（出口退稅專用）；
出口發票；
主管退稅機關要求提供的其他資料。
丟失出口收匯核銷單（出口退稅專用）
出口企業丟失出口收匯核銷單（出口退稅專用）的，可憑主管退稅機關出具的補辦出口收匯核銷單證明，向外匯管理局提出補辦申請。出口企業向主管退稅機關申請出具補辦出口收匯核銷單證明時，應提交下列資料：
關於申請出具補辦出口收匯核銷單證明的報告；
出口貨物報關單（出口退稅聯）；
出口發票；
主管退稅機關要求提供的其他資料。
丟失代理出口貨物證明
出口企業丟失代理出口貨物證明的，應由委托方先向其主管退稅機關申請出具代理出口未退稅證明。委托方在向主管退稅機關申請辦理代理出口未退稅證明時，應提交下列憑證資料：
關於申請出具代理出口未退稅證明的報告；
受托方主管退稅機關加蓋“已辦代理出口貨物證明”戳記的出口貨物報關單（出口退稅聯）；
出口收匯核銷單（出口退稅專用）；
代理出口協議（合同）副本及復印件；
主管退稅機關要求提供的其他資料。
受托方在向主管退稅機關申請補辦代理出口貨物證明時，應提交下列憑證資料：
關於申請出具補辦代理出口貨物證明的報告；
委托方主管退稅機關出具的代理出口未退稅證明；
受托方主管退稅機關加蓋“已辦代理出口貨物證明”戳記的出口貨物報關單（出口退稅聯）；
出口收匯核銷單（出口退稅專用）；
代理出口協議（合同）副本及復印件；
主管退稅機關要求提供的其他資料。