(1)辦公室
組織協調機關辦公的日常工作；負責起草、審核相關文件，組織重要會議；承擔辦公室主要工作的協調、監督和整合；組織綜合和專項調查研究；負責辦公室的消息處理、秘書事務和保密工作；負責辦公室和指導本系統的政務信息、新聞宣傳、信訪、檔案管理工作；承擔辦事處的財務、基礎設施、資產管理、後勤、安保和接待工作；負責辦公室自動化管理。
(2)政策法規司
組織起草國土資源、礦產資源方面的地方性法規、規章和規範性文件；研究提出全省國土資源立法規劃和計劃，負責有關法律、法規和政策問題的綜合協調；組織有關法律法規的宣傳教育；負責咨詢有關國土資源的法律法規；辦理有關行政復議和應訴；組織土地管理和礦產資源管理政策法規的調查研究；提出全省國土資源利用制度改革方案，研究制定改革措施；指導全省國土資源主管部門開展依法行政工作，負責依法行政工作的全面檢查。
(3)規劃辦公室
組織制定全省和重點地區土地綜合開發整治的政策措施，組織土地開發整治工作，負責安排實施土地整治業務計劃；起草和編制省級和區域土地規劃、土地利用總體規劃、礦產資源總體規劃和地質環境規劃；擬定全省土地供應政策；組織編制全省基本農田保護規劃、土地整理規劃、土地復墾規劃、未利用地開發規劃等專項規劃；指導和審查市、縣(市、區)、鄉(鎮)土地利用總體規劃、礦產資源規劃和地質環境規劃；參與審核上報國務院和省政府審批的城市總體規劃；負責各類計劃的協調銜接和實施監督管理；組織新開工項目用地預審；負責國土資源綜合統計。
(4)財務部
編制並實施年度財務計劃；制定並組織實施相關財務會計制度；指導直屬單位財務工作，監督管理直屬單位財務和國有資產；承擔國土資源資金、專項資金以及國家和省財政撥付的其他資金的財務管理；負責國土資源部門管理的各種行政事業性收費和專項收費的征收、管理和使用監督；協助財稅部門征收相關稅費。
(5)農田保護辦公室
負責全省耕地總量動態平衡管理和農用地轉用、土地征收管理；起草並組織實施耕地保護、耕地特別保護、耕地開墾、土地整理、土地復墾、未利用地開發和農用地轉用審批管理的相關規定；組織基本農田保護；負責建設用地補充耕地方案的審核；負責耕地占補平衡項目的監督管理；承擔省政府和國務院批準的各類建設項目農用地轉用和土地征用的審核、匯總和報批工作；負責征地的統壹組織和指導，組織起草征地補償辦法；參與重點建設項目用地的論證和驗收，對相關部門的建設用地進行指導和監督。
(6)地籍管理辦公室
統壹管理地籍工作；組織全省土地資源調查、地籍調查和變更調查、統計、確權、登記、發證、權屬變更、證書檢查和土地動態監測管理；承擔重大土地權屬糾紛的調解工作；指導和組織全省地籍信息系統建設。
(7)土地使用管理處
負責管理全省國有土地使用權的劃撥、出讓、租賃、定價、轉讓、交易和政府收購；負責審查具體建設項目的土地供應計劃；組織發布各類建設用地信息；跟蹤檢查各類建設項目的用地情況；組織實施全省國有土地劃撥和使用目錄指南，負責農村集體非農土地使用權流轉管理；指導基準地價和標定地價的評估，指導審計和評估機構從事土地評估，確認土地使用權價格；管理土地市場；負責國土資源資產管理的相關工作。
(8)地質勘探部門
負責地質勘查標準、規程和規範的執行；指導全省地質勘查工作，實施地質勘查行業管理；組織全省地質調查和礦產資源勘查評價，制定地質勘查規劃和計劃，並監督檢查實施情況；負責相關地質勘查項目的審批和管理；負責地質勘查單位資質的管理，負責探礦權的審批、登記、發證和轉讓；審查國外合作勘探區塊；調解地質勘查糾紛和爭議；審核從事探礦權評估的評估機構資質，組織確認國家出資的探礦權評估結果。
(9)礦產開發管理辦公室
依法辦理采礦審批登記發證和礦業權轉讓審批登記；受審計署委托，負責劃定礦區範圍和審核礦業權評估結果；組織制定全省礦產資源開發利用和保護規劃，負責礦產資源保護項目的審批和監督實施，參與礦山建設項目可行性論證的審查；組織礦產資源開發
研究資源綜合回收利用，推廣先進的礦產資源綜合利用技術方法；依法監督管理礦產資源的開發、利用和保護，組織礦產資源監管，維護全省礦業秩序；依法調解重大礦業糾紛和爭議，保護合法礦業權益；依法收取礦產資源補償費和采礦權使用費及價款；負責全省礦產資源開發信息系統的建設。
(10)礦產資源儲備司
組織實施礦產資源儲量管理的措施、標準、程序和規範；組織制定礦產資源政策和發展戰略；負責全省礦產資源儲量的登記和統計；負責全省礦產資源儲量表、年報的編報和礦產儲量的動態管理；負責全省礦產資源儲量評審機構的管理，以及礦產資源儲量評審結果的認定；經批準停止開采或者核銷閉坑礦山礦產儲量的；負責礦產資源儲量綜合利用的監督管理；參與礦山建設項目可行性論證的審查；承擔全省地質資料匯交工作，指導地質資料匯交工作。
(11)地質環境區劃
制定和實施地質環境保護和地質災害防治管理措施；負責礦產資源勘查開發過程中礦山生態環境保護的監督管理，組織礦山生態環境治理；編制和實施全省地質環境保護、地質遺跡保護和地質災害防治規劃；指導全省水文地質、工程地質和環境地質勘查評價工作；指導全省地質環境和地下水監測、評價和地質災害預警預報工作；組織協調全省地質災害防治工作，負責地質災害防治工程勘查、設計、施工、監理單位的資質管理；組織實施重大地質災害整治項目；負責建設用地地質災害危險性評估結果的認定；組織鑒定和保護具有重要價值的地質遺跡和地質景觀資源。
(12)執法監察局
組織對國家土地資源和礦產資源法律法規執行情況的監督檢查；制定全省國土資源執法監督和案件查處的有關規定；組織實施對土地規劃、礦產資源規劃、地質環境規劃、農用地轉用、土地征用、土地和礦產資源資產處置、土地使用權交易的監督檢查；依法組織查處重大國土資源違法案件。
(13)科學技術部
負責制定全省國土資源科技規劃；監督檢查重大科技項目的實施；促進科技進步，推廣新的科技成果；歸口管理全省國土資源信息工作。
(14)人事部
負責機關及直屬單位的機構設置、人事、勞動工資管理及相關培訓；承擔辦公室下屬單位領導班子建設的具體工作；負責全省國土資源系統科技人才的選拔、培養和管理；負責全省地質、礦業、土地、測繪行業專業技術職稱評審的相關工作；組織指導廳直屬單位的專業技術資格和職務評聘工作；制定教育培訓計劃，組織和指導全省國土資源系統的教育培訓工作；指導基層國土資源管理隊伍建設。
機關黨委。負責本部門和直屬單位的黨群工作；負責機關的思想政治工作、精神文明建設和作風建設。
建立壹個退休幹部部門。