設直屬機構1個，為稽查局，級別為副處級。稽查局組織落實稅務稽查法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體實施辦法；組織、協調稅收違法案件的查處、審理和執行工作；受理稅收違法案件的舉報；協調公安、檢察、審判機關處理稅務稽查有關工作；承擔金稅工程發票協查工作；牽頭組織稅收專項檢查工作。
市局稽查局設6個內設機構，級別為副科級，分別是：綜合科、綜合選案科、檢查科、案件審理科、案件執行科、舉報中心。