1、需要向國稅部門繳納增值稅，2016年5月1日後，應按規定繳納增值稅；醫院、診所和其他醫療機構提供的醫療服務免征營業稅；
2、計稅標準稅目為“生活服務”類“教育醫療服務”。該診所屬於提供醫療服務和藥品銷售；
3、起征點以下按季度申報，營業額達到9萬（含9萬）以下的享受國家優惠政策免征增值稅（但每季度必需零申報）。起征點以上按季度申報，季度營業額超過9萬的按定期定額戶管理繳納增值稅（具體稅額由稅務機關核定），稅率3% 。
《中華人民***和國營業稅暫行條例》
第八條
下列項目免征營業稅：
（壹）托兒所、幼兒園、養老院、殘疾人福利機構提供的育養服務，婚姻介紹，殯葬服務；
（二）殘疾人員個人提供的勞務；
（三）醫院、診所和其他醫療機構提供的醫療服務；
（四）學校和其他教育機構提供的教育勞務，學生勤工儉學提供的勞務；
（五）農業機耕、排灌、病蟲害防治、植物保護、農牧保險以及相關技術培訓業務，家禽、牲畜、水生動物的配種和疾病防治；
（六）紀念館、博物館、文化館、文物保護單位管理機構、美術館、展覽館、書畫院、圖書館舉辦文化活動的門票收入，宗教場所舉辦文化、宗教活動的門票收入；
（七）境內保險機構為出口貨物提供的保險產品。
除前款規定外，營業稅的免稅、減稅項目由國務院規定。任何地區、部門均不得規定免稅、減稅項目。